恩祺生物，自有生产工厂——浙江瑞峰生物制药有限公司，并在湖南省湘潭、四川省乐山、山东省济南设有合作生产基地。

浙江瑞峰生物制药有限公司：始建于2025年，总投资近10亿元人民币，占地面积约67000平方米，公司设有原料药（生物发酵、化学合成、高毒高活）生产线，计划于2027年三季度投产，制剂（生物药及化学药冻干粉、口服固、高毒高活）生产线，计划于2028年一季度投产。

湖南湘潭生产基地，始建于2017年，总投资2亿人民币，占地面积近60000 m²，总建筑面积15181.63 m²，生产车间总建筑面积约11000 m²；公司现有员工近120名，其中大专以上学历人员近60%，核心技术团队成员包括2名博士、4名硕士和40余名多年专业经验的研发、生产和工程技术人员；该基地能从事-100℃到300℃反应条件下，从克级到公斤级的中间体及原料药的工艺路线开发及产品订制加工，可生产百公斤到吨级的特色医药中间体及原料药；公司2022年10月获得药品生产许可证，2023年04月首次通过原料药的注册现场核查暨GMP符合性检查。

四川乐山基地，始建于2012年，占地近20000m²，建筑面积近8000m²。公司现有员工近100人，其中质量管理人员20余人。工厂建有4个化学合成车间、2个洁净车间，合计7条化学合成生产线、2条原料药生产线，反应釜容量从100L至3000L，计有100台。工厂以ISO、GMP为指导原则，建立了比较完善的质量管理体系，通过了ISO9001:2015、CFDA审计的质量管理体系认证；工厂QC建有连通HPLC、GC等精密仪器的网络版系统，最大的维护了检测数据的真实性。公司可以提供从公斤级，到吨位的高级医药中间体、原料药类产品。